Eppendorf循环管理器是以Windows为基础的软件，同时对一个或多个Mastercycler进行编程和控制。详尽的数据库确保可靠存储所有GLP相关实验数据，包括详细的用户注释。
| 处理器： |
Intel-Pentium II，266MHz |
| 内存： |
128 MB |
| 硬盘： |
1 GB 可用空间 |
| 图像分辨率： |
800 × 600 像素 |
| 操作系统： |
Windows 2000/NT |
| RS-232 接口卡：每台PCR仪一个自由接口－软件支持 COM1-COM16，用Exsys 接口卡（2,4 独立8 接口：EX-41092，EX-41094 和EX-41098）测试 |
| Mastercycler 家族的成员配有2.0 或更高版本的软件 |